이로쿼이 연방은 독립 전쟁 당시 북동부 지역에서 가장 강력한 아메리카 원주민 동맹이었습니다. 이로쿼이족은 오랫동안 영국의 동맹국이었으며 이전 전쟁에서도 영국군과 함께 싸웠습니다. 독립 전쟁이 발발했을 때 이로쿼이족은 처음에는 중립을 유지하려고 노력했습니다. 그러나 영국인들은 그들에게 토지와 기타 보상을 약속함으로써 그들이 자신들의 편에서 전쟁에 참여하도록 설득할 수 있었습니다.
체로키족은 남동부에서 가장 큰 아메리카 원주민 부족이었습니다. 그들은 처음에는 미국인들에게 우호적이었지만 미국인들이 그들의 땅에 정착하기 시작한 이후에는 그들에게 환멸을 느꼈습니다. 1776년에 체로키족은 영국인과 동맹을 맺었습니다. 그러나 미국인들은 일련의 전투에서 체로키족을 물리칠 수 있었고, 체로키족은 자신들의 땅의 대부분을 미국인들에게 양도할 수밖에 없었습니다.
다른 많은 아메리카 원주민 부족들은 독립 전쟁 중에 중립을 유지했습니다. 그들은 두 강력한 백인 집단 사이의 갈등에 연루되기를 원하지 않았습니다. 그들은 또한 양측의 싸움이 자국민의 파멸로 이어질 수 있다는 것을 두려워했습니다.
독립 전쟁은 아메리카 원주민에게 깊은 영향을 미쳤습니다. 그 결과 토지가 손실되고 전통적인 생활 방식이 파괴되었으며 아메리카 원주민 영토에 백인 정착지가 증가했습니다.